南宁市第二妇幼保健院始是一所二级甲等妇幼保健院，承担南宁市江南片区200万人口的妇女儿童保健工作。医院现址位于邕宁区汉林街60号，开设床位100张,在职职工349人。目前医院特殊儿童保健康复团队共63人，作为自治区残疾儿童康复救助定点机构、广西残疾儿童医教结合康复试点基地，致力于为广大特殊儿童提供身、心、智等全方位的优质保健康复服务，每年为特殊儿童提供康复服务超14万人次，彰显医院的社会责任和担当。
根据市政府部署，医院即将整体搬迁承建南宁市儿童医院、南宁市妇产医院。该院位于南宁市五象新区龙岗商务区永福路东侧，龙华路南侧，建设规模为500张床位的公立非营利性三级妇女儿童专科医院，项目总用地92亩，净用地面积40000平方米，总建设面积60979.64平方米，项目总投资74756.54万元。
医院目前还承建南宁市公立医院改革与高质量发展示范项目子项目 广西特殊儿童保健康复中心 ，拟命名 南宁市第二妇幼保健院滨湖院区 。该中心位于南宁市青秀区滨湖路70号（南宁地铁3号线滨湖路地铁站C出口，毗邻南宁市市委市政府），楼高19层，总建筑面积31468.61平方米。目标是三年内建成区内领军地位的特殊儿童保健康复中心和全区妇幼健康服务示范项目。项目计划2024年下半年投入使用。
医院还承接市政府为民办实事项目——开设两个托育示范园，分别是位于南宁市邕宁区托育示范园（建筑面积约400平方米）和位于南宁市青秀区滨湖路70号滨湖普惠托育示范园（使用面积约1200平方米）。